تحديد درجة القرابة بين الأنواع الحولية للجنس Cicer باستخدام المؤشرات الجزيئية
Abstract
كان الهدف من هذه الدراسة تحديد مؤشرات جزيئية مميزة لكل من الأنواع الحولية التسعة التابعة للجنس Cicer ومن ثم إنشاء شجرة قرابة توضح العلاقات الوراثية بين الأنواع التسعة باستخدام تقنية التفاعل التسلسلي للبوليميراز(PCR-RAPD) وفي النهاية تقدير كفاءة تقنية الـ RAPD في دراسة علاقات القرابة بين الأنواع. حلل DNA خمسة مدخلات من كل نوع وعشرة نباتات من كل مدخل باستخدام ثلاثين بادئة. تم الحصول على ثلاثمئة وستين حزمة متباينة من الـ DNA. تم تحديد قطع معينة من الـ DNA تسمح بالتمييز بين الأنواع المختلفة. أنشئت شجرة القرابة بين الأنواع الحولية التسعة اعتمادا" على نتائج مكاثرة الـ DNA مع البادئات الثلاثين. بينت النتائج بأن الأنواع C. arietinumو C. reticulatum وC. echinospermum هي الأكثر قربا" من بعضها البعض من الناحية الوراثية وهذا يتوافق مع علاقات القرابة المحددة مسبقا" اعتمادا" على معايير أخرى (شكلية وخلوية وحيوية وجزيئية) ، في حين تباين موقع أنواع أخرى تبعا" لنوع المعيار أو المؤشر المستخدم وهذا ما تم إيضاحه في المناقشة. سمحت نتائج هذه الدراسة بتحديد بادئات من الـ RAPD يمكن استخدامها وبدقة كمؤشرات في برامج تحسين نبات الحمص. كما أظهرت كفاءة استخدام هذه التقنية في دراسة علاقات القرابة بين الأنواع الحولية التابعة للجنس Cicer.The objectives of this study were the characterization and the establishment of phylogenetic relationships among nine annual Cicer species using PCR-RAPD markers. Then the evaluation of the efficiency of the RAPD technique in the Phylogenetic study. Five accessions per species and ten plants per accession were analyzed. 360 polymorphic fragments were generated using 30 decameric primers of arbitrary nucleotide sequences. Most of the primers produced very specific fragments.
Specific markers for each species were identified. Based on RAPD data, a dendrogram of genetic distance between the nine species was established. It showed that C.arietinum, C.reticulatum and C. echinospermum were the most close to each other while C. cuneatum was the farest one. Tree topology was compared with those based on other markers. The efficiency and reliability of RAPD data were demonstrated in the genus Cicer.
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
The authors retain the copyright and grant the right to publish in the magazine for the first time with the transfer of the commercial right to the Tishreen University Journal for Research and Scientific Studies - Biological Sciences Series
Under a CC BY- NC-SA 04 license that allows others to share the work with of the work's authorship and initial publication in this journal. Authors can use a copy of their articles in their scientific activity, and on their scientific websites, provided that the place of publication is indicted in Tishreen University Journal for Research and Scientific Studies - Biological Sciences Series . The Readers have the right to send, print and subscribe to the initial version of the article, and the title of Tishreen University Journal for Research and Scientific Studies - Biological Sciences Series Publisher
journal uses a CC BY-NC-SA license which mean
You are free to:
- Share — copy and redistribute the material in any medium or format
- Adapt — remix, transform, and build upon the material
- The licensor cannot revoke these freedoms as long as you follow the license terms.
- Attribution — You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use.
- NonCommercial — You may not use the material for commercial purposes.
- ShareAlike — If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original.
- No additional restrictions — You may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits.